1. 莆田市国家税务局内设机构
莆田市国家税务局内设机构，包括十三个级别为正科级的部门，各自承担着不同的职责，共同维护税收秩序和促进经济发展。
办公室负责机关文电、机要、会务、档案、督办、信访、保密、密码等工作，同时承担税收宣传、新闻发布及政务公开、政府信息公开，运营和维护网站。
政策法规科则负责组织落实综合性税收政策，审核机关有关规范性文件，办理行政复议、赔偿案件及行政诉讼案件，实施税收法律法规执行情况的监督检查，承担税收执法质量考核工作。
货物和劳务税科主要负责增值税、消费税、营业税、车辆购置税的征收管理工作，包括政策制定、业务解释、纳税评估、税源管理、税基管理和汇算清缴等。
所得税科负责企业所得税、储蓄存款利息所得税和法律法规规定的基金（费）的征收管理工作，制定具体实施办法，提供纳税辅导、咨询服务和税收法律救济。
收入核算科负责编制税收计划、出口退（免）税计划，分配下达年度免抵调库计划，监督税款缴、退库情况，进行税收收入分析预测，承担税收会计核算、统计核算、税收票证管理等工作。
纳税服务科组织协调纳税服务工作，实施纳税辅导、咨询服务、税收法律救济，受理纳税人投诉，指导税收争议调解，管理热线、网站纳税服务栏目和短信系统。
征收管理科负责落实综合性税收征管法律法规，拟订具体操作办法，组织实施综合性纳税评估，承担税务登记、纳税申报、普通发票管理、税控器具推广应用等工作。
财务管理科负责会计核算、会计基础规范，国库集中支付，基本建设、资产管理、政府采购、着装管理，实施财务管理、基本建设项目、大宗物品采购审计和领导干部经济责任审计。
人事教育科组织落实干部人事管理制度，承担人事工作，包括机构编制、干部任免、人员调配、劳动工资、人事档案、公务员管理、专业技术职务管理等，同时负责巡视工作和外事工作。
监察室组织落实纪律检查、行政监察工作，监督检查下一级领导班子及其成员的选拔任用、执行党风廉政责任制和廉政勤政情况，开展执法监察和纠风工作，受理对本系统工作人员违法违纪行为的检举、控告及申诉，查处违法违纪案件。
大企业和国际税务管理科提供大型企业的纳税服务，负责税源管理、纳税评估、日常检查，执行税收法律法规和国家（地区）间税收协议、协定，开展特别纳税调整工作，解释和处理具体业务问题。
机关党委办公室负责机关和直属单位的党群工作，承担机关思想政治工作和精神文明建设，开展入党积极分子的教育培训考察工作及发展党员工作。
离退休干部科承担机关离退休干部的服务和管理工作，指导本系统离退休干部工作，确保老干部权益得到保障。