1. 莆田市國家稅務局內設機構
莆田市國家稅務局內設機構，包括十三個級別為正科級的部門，各自承擔著不同的職責，共同維護稅收秩序和促進經濟發展。
辦公室負責機關文電、機要、會務、檔案、督辦、信訪、保密、密碼等工作，同時承擔稅收宣傳、新聞發布及政務公開、政府信息公開，運營和維護網站。
政策法規科則負責組織落實綜合性稅收政策，審核機關有關規范性文件，辦理行政復議、賠償案件及行政訴訟案件，實施稅收法律法規執行情況的監督檢查，承擔稅收執法質量考核工作。
貨物和勞務稅科主要負責增值稅、消費稅、營業稅、車輛購置稅的徵收管理工作，包括政策制定、業務解釋、納稅評估、稅源管理、稅基管理和匯算清繳等。
所得稅科負責企業所得稅、儲蓄存款利息所得稅和法律法規規定的基金（費）的徵收管理工作，制定具體實施辦法，提供納稅輔導、咨詢服務和稅收法律救濟。
收入核算科負責編制稅收計劃、出口退（免）稅計劃，分配下達年度免抵調庫計劃，監督稅款繳、退庫情況，進行稅收收入分析預測，承擔稅收會計核算、統計核算、稅收票證管理等工作。
納稅服務科組織協調納稅服務工作，實施納稅輔導、咨詢服務、稅收法律救濟，受理納稅人投訴，指導稅收爭議調解，管理熱線、網站納稅服務欄目和簡訊系統。
徵收管理科負責落實綜合性稅收征管法律法規，擬訂具體操作辦法，組織實施綜合性納稅評估，承擔稅務登記、納稅申報、普通發票管理、稅控器具推廣應用等工作。
財務管理科負責會計核算、會計基礎規范，國庫集中支付，基本建設、資產管理、政府采購、著裝管理，實施財務管理、基本建設項目、大宗物品采購審計和領導幹部經濟責任審計。
人事教育科組織落實幹部人事管理制度，承擔人事工作，包括機構編制、幹部任免、人員調配、勞動工資、人事檔案、公務員管理、專業技術職務管理等，同時負責巡視工作和外事工作。
監察室組織落實紀律檢查、行政監察工作，監督檢查下一級領導班子及其成員的選拔任用、執行黨風廉政責任制和廉政勤政情況，開展執法監察和糾風工作，受理對本系統工作人員違法違紀行為的檢舉、控告及申訴，查處違法違紀案件。
大企業和國際稅務管理科提供大型企業的納稅服務，負責稅源管理、納稅評估、日常檢查，執行稅收法律法規和國家（地區）間稅收協議、協定，開展特別納稅調整工作，解釋和處理具體業務問題。
機關黨委辦公室負責機關和直屬單位的黨群工作，承擔機關思想政治工作和精神文明建設，開展入黨積極分子的教育培訓考察工作及發展黨員工作。
離退休幹部科承擔機關離退休幹部的服務和管理工作，指導本系統離退休幹部工作，確保老幹部權益得到保障。